МРТ диагностика рака прямой кишки
Заказчик ФГБУ "НМИЦ им. А.Н. Рыжих" Минздрава России

  • Тип данных

    DICOM series/NIfTI (разметка в nrrd

  • Задача

    На основе DICOM-файлов модальности МРТ содержащих результаты МРТ-исследований аксиальной и коронарной T2-серий высокого разрешения предсказать:

    • опухоль на сериях срезов МРТ исследования
    • определение метастазов в лимфатических узлах малого таза
    • глубину инвазии опухоли в клетчатку
  • Эффекты
    • повышение эффективности стадирования рака толстой кишки
    • снижение затрат на химиотерапевтические препараты
    • снижение частоты осложнений химиотерапии
  • Классы разметки
    • опухоль
    • здоровый лимфоузел
    • метастатически измененный лимфоузел
    • прямая кишка
    • инвазия
  • Метрики качества

    Точность определения наличия опухоли на срезе = 77%

    DICE опухоли = 0,5

Разметка данных
Разметка выполнялась сотрудниками НМИЦ колопроктологии им. А.Н. Рыжих. В разметке данных принимали участие 5 врачей рентгенологов со стажем работы более 7 лет, из которых один специалист имеет звание ДМН, и один – КМН.
Каждое исследование размечалось одним специалистом.
При неоднозначной МР-картине и сложностях разметки привлекался второй специалист, врачи приходили к общему мнению на основании консилиума.
Инструмент разметки
Инструментом разметки выбрано ПО ITK-Snap, которое является специализированным инструментом для работы с медицинскими изображениями.
Это свободно распространяемое ПО с открытым исходным кодом, устанавливаемое на персональный компьютер.
Разметка сохраняется в формате NRRD.